Если почитать сам указ, то становится понятнее. Там список на 200 страниц из самых разнообразных российских компаний от танковых заводов до банков. А Яндекс и ВК - это просто частный случай. То есть указ по идее направлен против российского бизнеса, а не против вредной информации. Просто так получилось, что у компаний типа ВК весь бизнес в интернете. Но вообще я официальных обоснований от властей не слышала (и честно говоря, они мне мало интересны).